学校查重系统与知网查重在使用对象、功能定位、查重准确度等方面存在明显差异。学校查重系统主要针对学生、教师等内部人员使用，功能更加贴近学术写作需求，查重准确度相对较高，但覆盖范围可能较窄。知网查重则是一个面向全社会的查重平台，功能更加全面，覆盖范围广泛，但准确度可能受文献库资源影响。用户在选择时应根据具体需求和使用场景进行权衡。

此外，学校查重系统通常由学校自行开发或购买，具有一定的定制化特点，可以根据学校需求进行功能定制和优化；而知网查重则是一个第三方平台，用户无法对其功能进行定制。另外，学校查重系统可能会更加注重保护用户隐私和数据安全，而知网查重则更注重查重算法的创新和技术优势。综上所述，学校查重系统与知网查重在使用对象、功能定位、定制化程度、数据安全等方面存在明显区别，用户可根据具体需求选择适合的查重工具。